未遂政变发生后，金边市内气氛异常紧张。警察加强巡逻，严格检查来往车辆。柬政府第一首相拉那烈和第二首相洪森的住宅前都设置了路障，并有数十名士兵守卫，以防不测。柬政府又先后逮捕了与此案有牵连的100多人，其中包括一些政府官员和高级将领。此外，参与政变的国防部国务大臣斋桑云潜逃到国外，内政部高级官员索·乍姆兰和金萨兰躲藏起来，14名泰国人因被指控涉嫌政变也被拘捕，他们中间有1名警官，9名无线电通讯、武器和爆破方面的专家。7月6日，柬政府又在金边波成东机场抓住了准备乘飞机外逃的内政部国务秘书辛森。此人最初被认为与政变无关，甚至在7月4日从内政部副国务秘书被提升为国务秘书，但最终还是被查明不仅卷入政变，而且是政变的重要人物。事后，警察在辛森住所搜出了大量武器。
由于涉及此次政变的不少人是柬埔寨人民党成员，有人指控人民党与政变有关。但柬政府第二首相、人民党副主席洪森对此断然否认，称那是人民党叛徒所为。据柬政府公布的消息，原内政部部长辛松被捕后，供认人民党与政变有牵连，并说政变的目的旨在摧毁现政府，以便建立一个临时全国解放政府，然后举行议会和国家元首选举。